Το Τμήμα Γεωλογίας της Σχολής Θετικών Επιστημών του Αριστοτελείου Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης οργανώνει και λειτουργεί Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών με τίτλο: «Μετεωρολογία, Κλιματολογία και Ατμοσφαιρικό Περιβάλλον». Η χρονική διάρκεια φοίτησης στο Π.Μ.Σ.
Το Τμήμα Γεωλογίας του Αριστοτελείου Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης λειτουργεί Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών με τίτλο "Εφαρμοσμένη και Περιβαλλοντική Γεωλογία" στις εξής ειδικεύσεις: α) Τεχνική Γεωλογία και Περιβάλλον.
Το Τμήμα Οδοντιατρικής της Σχολής Επιστημών Υγείας του ΑΠΘ οργανώνει και λειτουργεί Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών (ΠΜΣ) με τίτλο "Ορθοδοντική" (Master in Orthodontics). Η χρονική διάρκεια για την απονομή του Διπλώματος Μεταπτυχιακών Σπουδών (Δ.Μ.Σ.) ορίζεται σε επτά (7) ακαδημαϊκά εξάμηνα.
Τα Τμήματα Αρχιτεκτόνων Μηχανικών, Μηχανολόγων Μηχανικών, Επιστημών Προσχολικής Αγωγής και Εκπαίδευσης του Α.Π.Θ.
Τα Τμήματα Αρχιτεκτόνων Μηχανικών, Πολιτικών Μηχανικών, Αγρονόμων και Τοπογράφων Μηχανικών, Μηχανολόγων Μηχανικών, Ηλεκτρολόγων Μηχανικών και Μηχανικών Υπολογιστών, Χημικών Μηχανικών της Πολυτεχνικής Σχολής του Α.Π.Θ.
Τα Τμήματα Χημικών Μηχανικών, Μηχανολόγων Μηχανικών, Ηλεκτρολόγων Μηχανικών και Μηχανικών Υπολογιστών της Πολυτεχνικής Σχολής και το Τμήμα Χημείας της Σχολής Θετικών Επιστημών του Αριστοτελείου Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης οργανώνουν και λειτουργούν το Διατμηματικό Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών με.
Το Τμήμα Χημείας του Αριστοτελείου Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης οργανώνει και λειτουργεί Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών στις εξής ειδικότητες: - Aνόργανη Xημεία και Χημεία Ανόργανων Υλικών - Kβαντική και Yπολογιστική Xημεία - Bιοχημεία - Oργανική Σύνθεση - Φυσικά Προϊόντα και Εφαρμογές.
Το Τμήμα Ηλεκτρολόγων Μηχανικών και Μηχανικών Υπολογιστών της Πολυτεχνικής Σχολής, το Τμήμα Ιατρικής της Σχολής Επιστημών Υγείας, το Τμήμα Μουσικών Σπουδών της Σχολής Καλών Τεχνών, το Τμήμα Δημοσιογραφίας και Μέσων Μαζικής Επικοινωνίας της Σχολής Οικονομικών και Πολιτικών Επιστημών του.
Το Παιδαγωγικό Τμήμα Δημοτικής Εκπαίδευσης (Π.Τ.Δ.Ε.) του Α.Π.Θ. οργανώνει και λειτουργεί Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών στις "Επιστήμες της Αγωγής" με κατευθύνσεις: Α. Κοινωνία, Εκπαίδευση και Παιδαγωγική Β. Διδακτική της γλώσσας και της λογοτεχνίας Γ.
Το Τμήμα Αγγλικής Γλώσσας & Φιλολογίας, σε συνεργασία με τα Τμήματα Φιλολογίας, Γαλλικής-Γερμανικής- καθώς και Ιταλικής Γλώσσας & Φιλολογίας του Α.Π.Θ., υλοποιεί Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών με τίτλο "Σπουδές Ευρωπαϊκής Λογοτεχνίας και Πολιτισμού".