Το Τμήμα Οικονομικών Επιστημών του Αριστοτέλειου Πανεπιστήμιου Θεσσαλονίκης οργανώνει και λειτουργεί Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών (Π.Μ.Σ.) στη "Διοίκηση και Οικονομία" στην κατεύθυνση "Οικονομική και Περιφερειακή Ανάπτυξη".
Το Τμήμα Οδοντιατρικής του Αριστοτελείου Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης οργανώνει και λειτουργεί Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών (Π.Μ.Σ.) στις ακόλουθες κατευθύνσεις: 1. Βασικές Επιστήμες Στόματος 2. Ενδοδοντολογία 3. Νοσοκομειακή Οδοντιατρική 4.
Τα Τμήματα Χημείας του Εθνικού και Καποδιστριακού Πανεπιστημίου Αθηνών (ΕΚΠΑ) και του Αριστοτελείου Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης (ΑΠΘ) υλοποιούν Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών για την απόκτηση διπλώματος στην ειδίκευση: "Χημική Ανάλυση - Έλεγχος Ποιότητας".
Τα Τμήματα: Ιατρικής της Σχολής Επιστημών Υγείας του Αριστοτέλειου Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης (ΑΠΘ) - Επισπεύδον Τμήμα, Ηλεκτρολόγων Μηχανικών και Μηχανικών Υπολογιστών της Πολυτεχνικής Σχολής του ΑΠΘ και Πληροφορικής της Σχολής Θετικών Επιστημών του ΑΠΘ οργανώνουν και λειτουργούν το Διατμηματικό.
Το Τμήμα Ιατρικής της Σχολής Επιστημών Υγείας του Αριστοτελείου Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης οργανώνει και λειτουργεί Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών με τίτλο: «Ερευνητική Μεθοδολογία στην Ιατρική και στις Επιστήμες Υγείας». Το Π.Μ.Σ.
Το Τμήμα Κτηνιατρικής της Σχολής Επιστημών Υγείας του Αριστοτελείου Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης οργανώνει και λειτουργεί το Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών (MSc) με τίτλο: «Ιατρική Ζώων Συντροφιάς». Το Π.Μ.Σ.
Το Τμήμα Δασολογίας και Φυσικού Περιβάλλοντος (ΔΠΦ).
Το Τμήμα Ιστορίας και Αρχαιολογίας της Φιλοσοφικής Σχολής του Α.Π.Θ. οργανώνει και λειτουργεί Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών (Π.Μ.Σ.) στους ακόλουθους κλάδους: A. Στον κλάδο της Ιστορίας 1. Αρχαία Ιστορία 2. Βυζαντινή και Μεσαιωνική Ιστορία 3.Νεότερη και Συγχρονη Ελληνική και Παγκόσμια Ιστορία 4.
Το Τμήμα Φιλοσοφίας και Παιδαγωγικής της Φιλοσοφικής Σχολής του Αριστοτελείου Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης οργανώνει και λειτουργεί Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών με τίτλο: «Παιδαγωγική Επιστήμη» στις εξής ειδικεύσεις: α) Ειδική Αγωγή β) Παιδαγωγική του Σχολείου γ).
Το Τμήμα Πολιτικών Επιστημών του Α.Π.Θ. οργανώνει και λειτουργεί Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών (Π.Μ.Σ.) στις παρακάτω ειδικεύσεις σπουδών: 1. Πολιτική Θεωρία και Φιλοσοφία 2. Πολιτική Ανάλυση 3. Πολιτική Ιστορία και Στρατηγικές Σπουδές 4.