Το Τμήμα Φαρμακευτικής της Σχολής Επιστημών Υγείας του Αριστοτελείου Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης οργανώνει και λειτουργεί Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών με τίτλο: «Φαρμακευτική Τεχνολογία». Η χρονική διάρκεια για την απονομή του Διπλώματος Μεταπτυχιακών Σπουδών (Δ.Μ.Σ.) ορίζεται σε τέσσερα (4).
Τα Τμήματα Ιατρικής της Σχολής Επιστημών Υγείας του Αριστοτελείου Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης και του Δημοκρίτειου Πανεπιστημίου Θράκης, συνδιοργανώνουν και λειτουργούν Διιδρυματικό Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών με τίτλο: «Νευροανοσολογία».
Τα Τμήματα Γαλλικής Γλώσσας και Φιλολογίας, Γερμανικής Γλώσσας και Φιλολογίας, Φιλοσοφίας και Παιδαγωγικής της Φιλοσοφικής Σχολής και Οικονομικών Επιστημών της Σχολής Οικονομικών και Πολιτικών Επιστημών του Αριστοτελείου Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης συνδιοργανώνουν και λειτουργούν Διατμηματικό.
Το Τμήμα Ιατρικής της Σχολής Επιστημών Υγείας του Αριστοτελείου Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης οργανώνει και λειτουργεί Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών με τίτλο: «Δημόσια Υγεία και Πολιτική Υγείας». Το Π.Μ.Σ.
Το Τμήμα Ιατρικής της Σχολής Επιστημών Υγείας του ΑΠΘ και το Παιδαγωγικό Τμήμα Δημοτικής Εκπαίδευσης της Παιδαγωγικής Σχολής, του Πανεπιστημίου Δυτικής Μακεδονίας (ΠΔΜ) οργανώνουν και λειτουργούν Διιδρυματικό Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών με τίτλο: «Κριτική σκέψη και ήπιες δεξιότητες (soft skills).
Το Τμήμα Ιατρικής της Σχολής Επιστημών Υγείας του Αριστοτέλειο Πανεπιστήμιο Θεσσαλονίκης οργανώνει και λειτουργεί Αγγλόφωνο Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών με τίτλο: «Ιατρική Ερευνητική Μεθοδολογία» (Medical Research Methodology).
Το Τμήμα Ιατρικής της Σχολής Επιστημών Υγείας του Α.Π.Θ. και του Τμήματος Ιστορίας & Εθνολογίας της Σχολής Κλασικών & Ανθρωπιστικών Σπουδών του Δ.Π.Θ.
Το Τμήμα Αγγλικής Γλώσσας και Φιλολογίας του Αριστοτελείου Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης οργανώνει και λειτουργεί Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών στην Γλώσσα, Λογοτεχνία και Ψηφιακά Μέσα στην Εκπαίδευση.
Το Τμήμα Αγγλικής Γλώσσας και Φιλολογίας του Αριστοτελείου Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης οργανώνει και λειτουργεί Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών στην Εκμάθηση και Διδασκαλία Ξένης Γλώσσας.
Το Τμήμα Αγγλικής Γλώσσας και Φιλολογίας της Φιλοσοφικής Σχολής του ΑΠΘ οργανώνει και λειτουργεί Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών με τίτλο: «English and American Studies (Αγγλικές και Αμερικανικές Σπουδές)».