Το Ελληνικό Ανοικτό Πανεπιστήμιο σε συνεργασία με το Πανεπιστήμιο Λευκωσίας οργανώνουν και λειτουργούν Μεταπτυχιακό Πρόγραμμα Σπουδών (ΜΠΣ) με τίτλο «Τραπεζική, Λογιστική και Χρηματοοικονομική» (Master in Banking, Accounting and Finance).
Η Σχολή Εφαρμοσμένων Τεχνών του Ελληνικού Ανοικτού Πανεπιστημίου υλοποιεί Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών με τίτλο «Σχεδιασμός Φωτισμού». Το Π.Μ.Σ. «Σχεδιασμός Φωτισμού» διαρθρώνεται σε δύο (2) έτη, τα οποία περιλαμβάνουν τέσσερεις (4) ετήσιες θεματικές ενότητες και εκπόνηση διπλωματικής εργασίας.
Η Σχολή Θετικών Επιστημών και Τεχνολογίας του Ελληνικού Ανοικτού Πανεπιστημίου υλοποιεί μεταπτυχιακό πρόγραμμα με τίτλο: "Συστήματα Κινητού και Διάχυτου Υπολογισμού". Το Π.Μ.Σ. «Συστήματα Κινητού και Διάχυτου Υπολογισμού» διαρθρώνεται σε δύο (2) έτη.
Η Σχολή Εφαρμοσμένων Τεχνών του Ελληνικού Ανοικτού Πανεπιστημίου υλοποιεί το Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών με τίτλο: «Γραφικές Τέχνες - Πολυμέσα». Το Π.Μ.Σ. «Γραφικές Τέχνες - Πολυμέσα» διαρθρώνεται σε δύο (2) ακαδημαϊκά έτη.
Η Σχολή Θετικών Επιστημών και Τεχνολογίας του Ελληνικού Ανοικτού Πανεπιστημίου υλοποιεί Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών με τίτλο «Μεταπτυχιακή Ειδίκευση Καθηγητών Φυσικών Επιστημών». Το Π.Μ.Σ. «Μεταπτυχιακή Ειδίκευση Καθηγητών Φυσικών Επιστημών» απαιτεί την επιτυχή παρακολούθηση τεσσάρων (4).
Η Σχολή Θετικών Επιστημών και Τεχνολογίας του Ελληνικού Ανοικτού Πανεπιστημίου θα λειτουργήσει το Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών με τίτλο «Μεταπτυχιακή Εξειδίκευση στα Πληροφοριακά Συστήματα». Το Π.Μ.Σ.
Η Σχολή Θετικών Επιστημών και Τεχνολογίας του Ελληνικού Ανοικτού Πανεπιστημίου υλοποιεί Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών με τίτλο «Μεταπτυχιακές Σπουδές στα Μαθηματικά». Το Π.Μ.Σ. απονέμει Μεταπτυχιακό Δίπλωμα Ειδίκευσης στις ακόλουθες κατευθύνσεις: Θεωρητικά Μαθηματικά (επιλογή «Ανάλυση» ή «Άλγεβρα.
Η Σχολή Θετικών Επιστημών και Τεχνολογίας του Ελληνικού Ανοικτού Πανεπιστημίου υλοποιεί Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών με τίτλο «Περιβαλλοντική Κατάλυση για Αντιρύπανση και Παραγωγή Καθαρής Ενέργειας». Το Π.Μ.Σ.
Η Σχολή Θετικών Επιστημών και Τεχνολογίας του Ελληνικού Ανοικτού Πανεπιστημίου θα λειτουργήσει το Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών με τίτλο «Προχωρημένες Σπουδές στη Φυσική». Το Π.Μ.Σ. «Προχωρημένες Σπουδές στη Φυσική» διαρθρώνεται σε δύο (2) έτη.
Η Σχολή Θετικών Επιστημών και Τεχνολογίας του Ελληνικού Ανοικτού Πανεπιστημίου υλοποιεί Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών με τίτλο «Σεισμική Μηχανική και Αντισεισμικές Κατασκευές». Το Π.Μ.Σ. «Σεισμική Μηχανική και Αντισεισμικές Κατασκευές» διαρθρώνεται σε δύο (2) έτη.